無菌の状態、すなわち、生きた微生物がいない状態にする操作のことをいう。
滅菌方法には次の方法がある。
①火焔滅菌：
火焔の中で赤熱する。
②乾熱滅菌：
乾熱滅菌器（電熱、ガス熱いずれかを用いる）を用いて、器内の空気温度を１６０℃とし、１時間放置する。
③高圧滅菌：
高圧釜（オートクレープ）を用いて器内の蒸気圧を２気圧/㎝²（１２１℃）に上昇させ２０分間以上放置する。
④濾過滅菌：
濾過滅菌器（ザイツ型、シァンベラン型、メンブランフィルター）を用いて細菌を濾過してしまう方法。
⑤間欠滅菌：
常圧の蒸気（１００℃）で３０分間加熱したのち１日放置する。これを３回くり返す方法。
